Gene Ontology(GO)中文名稱叫做"基因本體"，是由Gene Ontology Consortium組織所建立的一套具有動態(dynamic)形式的控制字匯(controlled vocabulary)，透過整合性的分類系統，將所有真核生物或蛋白質都基於此系統下做註解與分類。用來幫助處理日益劇增的生物信息。目前Gene Ontology底下包括三個域分別是biological process, molecular function及cellular component。
- cellular component:細胞的每個部分和細胞外環境。
- molecular function:基因產物在分子級別的主要活動，比如結合以及催化。
- biological process:細胞內發生的，可以定義開始和結束的事件或行動
一個基因或蛋白質可從這三個層面來註解，首先是構成在細胞內的特定元件(cellular component)，其次是此元件在分子功能上所扮演的角色(molecular function)，最後生物學家一定想知道這基因或蛋白質到底參與哪些生物過程(biological process)。
